Время от времени в некоторых средствах массовой информации появлялись материалы клеветнического толка и содержания о деятельности КГМА имени И.К.Ахунбаева.
В этой информационной кампании против медакадемии заинтересованы несколько человек, а именно: Зиябидин Айдаров, Камил Умаров и Таалай Айдаров. Зиябидин Айдаров еще при поступлении в мединститут не смог написать диктант по русскому языку, позже, будучи преподавателем, слыл среди студентов «главным разводящим», получил звание профессора путем подложных документов и из-за допущения фальсификации в научном отчете был уволен из КГМА, долго судился с вузом и в результате проиграл судебные тяжбы. Пока руководство ВАК сохраняет за ним звание «профессор». Однако после проверки данного вопроса по поручению президента Кыргызской Республики Генеральной прокуратурой внесено представление на имя премьер-министра об устранении нарушений законности со стороны ВАК от 16 декабря 2014 года (письмо Генеральной прокуратуры КР от 07.05.15. №11/3-60-14).
Другой жалобщик, Камиль Умаров, распространяющий заведомо ложную информацию о деятельности медакадемии Кыргызстана и ряда других организаций и учреждений, 28 мая 2015 года решением общего собрания АКОС (Антикоррупционное общественное содействие), исключен из указанного объединения, а филиал АКОС в Чуйской области закрыт. Об этом свидетельствует справка, данная руководителем АКОС прокуратуре Аламудунского района от 19 июня сего года под номером 28. 11 мая 2015 года состоялся сельский сход Байтикского айильного округа Аламудунского района, и собравшиеся предложили местным правоохранительным органам «возбудить уголовное дело в отношении К.Умарова за клевету». Они требовали от властей отныне не рассматривать его жалобы в государственные и правоохранительные органы, а его самого попросили покинуть родное село. Конфликты с коллективом медакадемии у К.Умарова происходили еще с 1990 года, когда из-за клеветы на собственного наставника, бывшего ректора КГМИ, академика С.Б.Даниярова, сотрудники кафедры физиологии единогласно выступили против переизбрания Умарова на должность доцента, и он был уволен.
Третий жалобщик, Таалай Айдаров, представляется и «героем Апрельской революции», и заместителем председателя ОО «Люстрация». Однако в письмах руководителей ОО «Айкөл Ала-Тоо» и «Эр теги» М.Мискенбаева и О.Жамансариева, адресованных премьер-министру КР, говорится о том, что Таалай Айдаров вовсе не является «героем Апрельской революции», более того, он 7 апреля 2010 года находился в городе Санкт-Петербурге. А по сообщению председателя ОО «Люстрация» Л.Усубалиевой от 28.06.2015, Т.Айдаров еще в 2013 году был уволен из организации из-за распространения неправдивой информации и непристойные действия.
КГМА несколько раз обращала внимание общественности на тенденциозные попытки профессиональных жалобщиков очернить все и вся, а также на их сомнительную репутацию. Под видом борьбы с коррупцией они нечистоплотными методами пытаются внести смуту в многотысячный интернациональный коллектив академии.
По жалобам К.Умарова, Т.Айдарова и З.Айдарова КГМА около 20 раз проверяли различные государственные, правоохранительные, фискальные органы республики и ничего существенного и противозаконного не обнаружили. Однако в связи с проверками и повышенным вниманием СМИ ответственные работники и ППС вуза вместо того, чтобы заниматься обучением и воспитанием подрастающего поколения, часто отвлекались от основной деятельности.