Одним из рисков работы АО «КазТрансГаз» является несанкционированный отбор газа со стороны Кыргызстана. Об этом говорится в отчете компании за 2012 год.
Кроме того, в перечень рисков включены опасения невозврата вложенных инвестиций в создание совместного с Кыргызстаном предприятия «КырКазГаза». Следует отметить, что СП создано в 2005 году, оно эксплуатировало магистральный газопровод, расположенный на севере Кыргызстана. Кыргызская сторона его обслуживала, а казахская - вкладывала инвестиции. С 2005 года Казахстан инвестировал в газотранспортную сеть на севере Кыргызстана $11,9 миллиона.
Напомним, что кыргызско-казахский межправительственный совет поручил ОсОО «Кыргызгазпром» при передаче активов российскому «Газпрому» принять на свой баланс обязательства по долгам ОАО «Кыргызгаз» до 1 декабря 2013 года за несанкционированный отбор газа в 2003-2006 годах в размере $13 миллионов. Совет поручает заключить соглашение, предусматривающее передачу вновь введенных активов, созданных за счет инвестиций АО «КазТрансГаз» в размере $11,9 миллиона.